1. 珊瑚礁等典型生态系统中无脊椎动物共生微生物多样性、微生物与宿主的共生机制及共生关系的演化。
2. 珊瑚礁、冷泉等典型生态系统中的微生物关键类群富集、培养策略，及深海微生物原位实验技术和装备的研发。
3. 岛礁生物土壤结皮结构特征、培植技术及生态水文功能。

2007-9至2010-6，云南大学，微生物学，理学博士
2004-9至2007-6，西南林学院，植物学，理学硕士
2000-9至2004-7，西南林学院，生物技术，理学学士

2017-12至现在，中国科学院南海海洋研究所，研究员
2014-1至2014-6，University of California, San Diego, Scripps Institution of Oceanography，访问学者
2012-12至2017-11，中国科学院南海海洋研究所，副研究员
2010-7至2012-11，中国科学院南海海洋研究所，助理研究员

1. 提升珊瑚抗逆性的人工益生菌群构建和作用机制，主持，国家自然科学基金区域创新发展联合基金-重点支持项目，2024.01-2027.12
2. 生物结皮培植技术，主持，国家重点研发计划课题，2022.12-2025.11
3. 热带海洋共生微生物多样性与生态，主持，国家自然科学基金优秀青年科学基金项目，2022.01-2024.12
4. 面向深海典型生态系统的功能微生物原位探测技术，主持，院科研仪器设备研制项目，2022.01-2023.12
5. 南海冷泉化能生态系统演化的生地化过程驱动机制，主持，南海海洋研究所基础前沿与创新发展重点项目，2022.10-2025.10
6. 南海典型海岛生态建设与生态物联网监测技术研究与示范—课题3南海典型海岛生态系统恢复的生物膜技术，主持，国家重点研发计划项目课题，2017.07-2020.12
7. 热胁迫下珊瑚组织中细菌群落的变化及其对珊瑚热耐受的作用，主持，国家自然科学基金面上项目，2017.01-2020.12
8. 珊瑚内共生丙酸杆菌益生作用机制及在珊瑚培育中的应用基础研究，主持，广东省杰出青年科学基金项目，2017.05-2021.05

累计发表学术论文120余篇。以第一和通讯作者在Engineering、Environmental Microbiology、Environmental Microbiome、mSystems、Coral Reefs等工程和微生物领域主流期刊发表SCI论文63篇。参编由科学出版社出版的专著4部。获授权发明专利22件，美国专利2件，公开PCT专利2件。

代表性论文：
(1) Jie Li#*, Qingsong Yang#, Junde Dong, Michael Sweet, Ying Zhang, Cong Liu, Yanying Zhang, Xiaoyu Tang, Wenqian Zhang, Si Zhang*. Microbiome Engineering: A Promising Approach to Improve Coral Health. Engineering, 2023, 28:105-116.
(2) Jie Li*, Anjie Guo, Sijun Huang, Farooq Azam, Xinyuanyuan Sun, Jian Zhang, Lijuan Long, Si Zhang. Outer membrane vesicles produced by coral-associated Vibrio coralliilyticus inhibit bacteriophage infection and its ecological implications. Microbiological Research, 2024, 281:127607.
(3) Jie Li*, Yiyang Zou, Qiqi Li, Jian Zhang, David G. Bourne, Yuanjiao Lyu, Cong Liu, Si Zhang. A coral-associated actinobacterium mitigates coral bleaching under heat stress. Environmental Microbiome, 2023, 18(1):83.
(4) Jie Li*, Yiyang Zou, Jian Yang, Qiqi Li, David G Bourne, Michael Sweet, Cong Liu, Anjie Guo, Si Zhang. Cultured bacteria provide insight into functional potential of the coral-associated microbiome. mSystems, 2022, 7(4):e00327-22
(5) Jie Li*, Lijuan Long, Yiyang Zou, Si Zhang. Microbial community and transcriptional responses to increased temperatures in coral Pocillopora damicornis holobiont. Environmental Microbiology, 2021, 23(2): 826-843.

获广东省科技进步一等奖（排名第4，2019）
入选中科院青年创新促进会会员（2017）
广东特支计划百千万工程青年拔尖人才（2016）
广州市珠江科技新星（2014）

担任Engineering、《热带海洋学报》编委
Frontiers in Microbiology、Frontiers in Marine Science期刊Associate Editor